Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms