Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LBPP18428 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LBPP18428 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LBPP18428 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms