Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms