Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms