Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3P10147 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms