Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1F0P07305 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms