Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms