Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms