Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SCN2BO60939 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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