Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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