Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms