Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms