Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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