Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TVP23AA6NH52 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TVP23AA6NH52 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TVP23AA6NH52 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TVP23AA6NH52 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TVP23AA6NH52 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms