Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35F4A4IF30 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms