Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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