Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms