Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms