Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5BQ9UGL1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms