Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms