Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms