Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms