Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC8Q9BY41 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms