Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3R4Q99570 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms