Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms