Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms