Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms