Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms