Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms