Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms