Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms