Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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