Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms