Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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