Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HIST3H3Q16695 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HIST3H3Q16695 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HIST3H3Q16695 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HIST3H3Q16695 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HIST3H3Q16695 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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