Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PDK4Q16654 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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