Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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SCN9AQ15858 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SCN9AQ15858 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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SCN9AQ15858 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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