Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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