Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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