Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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