Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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