Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDK5R1Q15078 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms