Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SSPNQ14714 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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