Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD11Q14690 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD11Q14690 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD11Q14690 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD11Q14690 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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