Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms