Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms