Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms