Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIM1P81133 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms