Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms