Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-21P61565 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms